11、《疑似浪漫》
世界卫生组织向“医学调查”发来急电，CDC惊闻埃博拉病毒可能进入中国，所有目标都集中在曾与患者有染的女孩刘睿身上。而刘睿正是关海当年的梦中情人。隔离期，关海负责看护刘睿，随着真相一点点查清，他慢慢发现刘睿并不值得自己去爱。陈思源也差点被刘睿迷惑，结果查清，仅仅是一场虚惊，两个男人却一起感慨这场突来的浪漫像梦一般虚幻……
12、《非常诱惑》
出租司机一家神秘中毒，他们居住的院子笼罩着恐怖气息。林碧找来大学同学现稀有金属专家王迈前来配合，帮助CDC找出了中毒源是铊！而毒源失踪。在去研究所与王迈接触中，陈思源感受到了这个徘徊在利与理想之间饱受摧残的痛苦灵魂，王迈痛恨现实不能给自己一个宽松的研究环境，得到CDC所有人的理解。随着真相大白，陈思源揭穿王迈正是那家人中毒的始作俑者……
13、《同一片天》
一个卖光盘的外地妇女的孩子患了流行性脑膜炎，而这个孩子又将病毒传给了城里所谓富人的孩子，面对着大量外地务工人员拥进我们这个城市，而他们又游离在正常的防疫系统之外，使得CDC面临着从来没有过的困惑。接近退休的乡级防疫人员老莫干了一辈子卫生防疫工作，他总是对民工、保姆等外来务工人员的卫生防疫十分关注，由于他的执着，帮助CDC小组找到了脑膜炎传播的病源，同时也使得CDC加强了外来务工人员的卫生防疫工作。
14、《苹果的滋味》
陈思源在练习居合道的健身俱乐部结识了年轻漂亮的健身教练金子，并深深为金子充满活力和独特的个性所吸引，却在某山区调查不明原因的神经炎症症状的疫情时，惊讶地发现山区患者身上的红斑跟金子身上的一模一样。疾病被确诊为被昆虫蜱叮咬后导致的莱姆病，而金子身上检到的病原体与疫源地证实是同一传染源，但金子却否认去过该山区。陈思源等正探询为什么会在远离疫源地的大城市单独出现这一例病例时，无意中又在该俱乐部老总罗刚身上发现了同样的红斑。但罗刚也否认去过疫源地。在CDC科学缜密、锲而不舍的追寻下，终于查明了这两起城市病例的疫情真相，并无意中获知了金子与罗刚以及一个大龄富婆之间令人慨叹的情感事件，令人感叹现代人在对大自然和情感世界的探险时都会带来许多始料不及的新冲击……
15、《孤独拯救》
警方抓获的两名外籍入境毒贩感染我国从未出现过的烈性传染病：马尔堡病毒病。世卫组织专家Lutz和助手Peter前来协助CDC工作。经查，毒贩入境后一直呆在屋里，被捕前只跟快餐店送餐员接触。CDC找到送餐员予以隔离，并追查送餐员接触的人群。年轻的富家女孩小炎从小父母离异，享受不到人和人之间正常感情和温暖的她不停地以婚前体检为名目，约跟她好过的不同男人来CDC验血查艾滋病，给忙碌的CDC带来不少干扰。送餐员接触过的酒吧调酒师强子发病，确诊马尔堡。在追踪强子接触人群的过程中，CDC来到了小炎家。原来强子不久前参加过小炎家举行的party，并无意中跟小炎共用过同一只润唇膏。小炎坚决不接受CDC必须对她进行的全面体检，已怀孕两个月的她现在想要的就是一个健康的孩子，一个纯洁的生命来填满她内心的孤独和空虚，最终在陈思源、林碧等的劝导下小炎重获积极健康的生命信心，而此次跟世卫组织合作的经验也使CDC也成功地完成了“新发传染病防治技术研究与应用”的课题
16、《职业异情》
CDC在某集团搞结核病防治过程中，林碧结识了配合工作的方茹，方茹请求林碧帮她解决一个难以启齿的问题——查出丈夫为何对夫妻生活没有兴趣。林碧前往方茹丈夫的车间进行调查，竟然发现这里所有男职工都面临这个问题。在取得他们信任后，林碧查出了不明污染的真相，林碧力图用自己的工作挽救方茹的家庭，却不料已经晚了，方茹已经忍受不了丈夫的冷漠，在外找到了新的感情归宿……
17、《一见钟情》
几个病人出现不明病因的症状，已经进入抢救室，生命危在旦夕。陈思源和林碧急忙赶往医院，大家将患者的血清拿回化验，林碧发现是具有传染性的霍乱。一个病人说出，她参加了一个叫“八分钟约会”的联谊会，她在其中认识了一个男人张志君，并和他交往。
关海和徐崴崴开始寻找八分钟约会中的参加人员，由于他们都是通过网络联系，都不知道真实姓名，这过程充满了难以想象的谎言和逃避，张志君不仅和这名女子保持着联系，还有几个别的女孩(其中一个已经入院)也和他有关系，张志君和众多女子的这种游戏爱情的现代观念给派查的过程带来了困难。最后一个女子“夏天的黄昏”找到了，这场情感的瘟疫终于看似平静的消失了。
18、《肝胆相照》
小泉乡一共六个自然村，有五个都暴发了甲肝，只有双槐村没一个人发病。这引起了陈思源的注意。在陈思源进村的时候，他就发现一个三十多岁的男人背着个消毒机在村口打着药。这个人就是乡小学校的教师宋权。陈思源通过调查，发现双槐村民没有人被传染上的原因就是因为宋权老师几年如一日在村民和学生中宣传卫生知识，和他身体力行地对环境卫生的整治。然而，一个偶然的机会，宋权老师是乙肝“小三阳”病毒携带者的消息不胫而走，在城里因被用人单位歧视的大学毕业生宋权面临着再次被迫远走他乡的困境。终于，在CDC工作的法医老谢对他伸出了援助之手……
19、《签约时节》
市郊富甲一方的石岭农工商总公司发生疑似疫情事件，CDC接到匿名举报，感到现场，可是财大气粗的镇长告诉他们只是虚惊一场，不存在传染疫情，只是有人因为与镇长不睦而蓄意捣乱。
陈思源敏锐地发现事情并非镇长粉饰的那么简单，他和土财主之间的较量就此展开，尽管一开始有着秀才遇见兵的不便，但执着的责任感还是让他看到了疫情的端倪——轮状病毒。
此时恰好是一个美国财团来石岭考察投资之际，疫情的披露使得投资陷入僵局。就在众人都以为投资行为大势已去之际，美国商人却向他们伸出了友好之手：感动这个商人的，正是CDC的拳拳之心。
20、《危险链条》
一名在家休学的大学生孙兢兢生病，经查感染了S病毒。CDC立刻行动起来，查找传染源和传播链。外地医院也上报说有一例疑似S病毒患者。这些独立的病例叫CDC很头痛。找不出其中的关联。围绕大学生，CDC展开调查，毫无线索。到CDC实习来的大学生吴小姹看到隔离的孙兢兢赶到惊慌失措，操作起来险些酿成大祸。陈思源从孙兢兢的言谈中感觉她显然隐瞒着什么。有一个电话打来，说自己感染的S病毒，并且已经把自己隔离了起来。CDC人员赶去，发现竟然是吴小姹。在关海的推理之下，吴小姹终于说出了她的传染源-男朋友刘波。刘波是医科大学的研究生。是他把S病毒从实验室中不小心带了出来。而他自己却因为曾经感染过S病毒而具有了免疫力。而且，他已经办好了签证手续马上就要出国留学。刘波和外地那名患者曾经在同一实验室。而孙兢兢是刘波过去的女友。
传播链终于找到了。发现及时没有引起社会恐慌。